国立大学法人琉球大学医学部

講座紹介：

Department of Investigative Medicine

Principle investigator
　Professor　Akio Yamashita, Ph.D.
　e-mail: akyama21[at]med.u-ryukyu.ac.jp　　　　　　　　　
　 (please replace [at] to @)
　Tel: +81-98-895-1202

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　Admission Requirements.

From all countries.
　Privately-Financed International Students
　Monbukagakusho Honors Scholarship
　Japanese Government (Monbukagakusho:MEXT) Scholarships

　From Asia and Africa or other specified countries.
　JSPS RONPAKU (DISSERTATION Ph. D.) program

　From France, Germany, Sweden, the UK, Canada.
　JSPS postdoctoral fellowships for research in Japan.

Our research

Human gene expression is exquisitely regulated at several points of between transcription and protein synthesis to ensure fidelity in the conversion of genetic information into biological functions. Nonsense-mediated mRNA decay (NMD) is a post-transcriptional surveillance pathway responsible for the recognition and degradation of mRNAs containing premature termination codons. NMD protects cells from nonfunctional, potentially harmful, polypeptides encoded by mutated mRNAs. On the other hand, NMD degrade frameshift or miss-spliced mRNAs encoding cancer antigen. Hence, manipulation of NMD activity will benefit to improve anti-cancer immune response. We are challenging this fundamental post-transcriptional gene expression regulation pathway and developing novel drugs for cancer and rear genetic diseases. Using our original technique, which developed during basic analysis of NMD, we are analyzing disease related post-transcriptional event of gene expression mechanisms. The goal of the research is to find the critical factors of diseases and develop/perform the primary compound screening targeting these factors.

Selected publications

1. Mino T., Iwai N., Endo M., Inoue K., Akaki K., Hia F., Uehata T., Emura T., Hidaka K., Suzuki Y., Standley D.M., Okada-Hatakeyama M., Ohno S., Sugiyama H., Yamashita A., Takeuchi O.* Translation-dependent unwinding of stem-loops by UPF1 licenses Regnase-1 to degrade inflammatory mRNAs. Nucleic Acids Res 47, 8838-8859, 2019.

2. López-Perrote A., Castaño R., Melero R., Zamarro T., Kurosawa H., Ohnishi T., Uchiyama A., Aoyagi K., Buchwald G., Kataoka N., Yamashita A.*, Llorca O.* Human nonsense-mediated mRNA decay factor UPF2 interacts directly with eRF3 and the SURF complex. Nucleic Acids Res 44, 1909-1923, 2016.

3. Usuki F.*, Yamashita A., Shiraishi T., Shiga A., Onodera O., Higuchi I., Ohno S. Inhibition of SMG-8, a subunit of SMG-1 kinase, ameliorates nonsense-mediated mRNA decay-exacerbated mutant phenotypes without cytotoxicity. Proc Natl Acad Sci USA 110, 15037-15042, 2013

4. Kashima I., Yamashita A., Izumi N., Kataoka N., Morishita R., Hoshino S., Ohno M., Dreyfuss G., Ohno S.* Binding of a novel SMG-1-Upf1-eRF1-eRF3 complex (SURF) to the exon junction complex triggers Upf1 phosphorylation and nonsense-mediated mRNA decay. Genes Dev 20, 355-367, 2006.

5. Yamashita A., Chang T..C, Yamashita Y., Zhu W., Zhong Z., Chen C.Y., Shyu A.B.* Concerted action of poly(A) nucleases and decapping enzyme in mammalian mRNA turnover. Nat Struct Mol Biol 12, 1054-1063, 2005.

6. Yamashita A., Ohnishi T., Kashima I., Taya Y., Ohno S.* Human SMG-1, a novel phosphatidylinositol 3-kinase-related protein kinase, associates with components of the mRNA surveillance complex and is involved in the regulation of nonsense-mediated mRNA decay. Genes Dev 15, 2215-2228, 2001

スタッフ紹介：

• 
  教授：山下 暁朗　　　　　　Akio Yamashita略歴：
  

  平成 4年 3月 　兵庫県立須磨東高等学校　卒業
  平成 8年 3月 　日本大学農獣医学部 応用生物科学 卒業
  平成10年 3月　横浜市立大学 大学院総合理研究科システム機能専 修士課程 修了
  平成13年 9月　横浜市立大学 大学院 医研究科生化第二専攻　博士課程　修了
  平成13年 9月　博士(医学)
  平成11年 4月　日本学術振興会　特別研究員（DC1）（横浜市立大学）
  平成13年10月　日本学術振興会　特別研究員（PD）（横浜市立大学）
  平成14年 4月　木原記念横浜生命科学振興財団 博士研究員（横浜市立大学）
  平成15年 4月　米国テキサス大学医学部 生化学・分子生物学教室（Dr. Ann-Bin Shyu）　博士研究員 (留学)
  平成17年 4月　横浜市立大学医学研究科　分子細胞生物学講座　COE特任助教
  平成19年 9月　日本学術支援機構 さきがけ専任研究員
  平成22年 4月　横浜市立大学医学部　　講師
  平成28年 4月 　横浜市立大学医学部　　准教授
  令和 3年 2月 　 横浜市立大学　大学院医学研究科　客員教授
  令和 3年 2月 　 琉球大学　大学院医学研究科　教授

  
  

  受賞
  平成13年 3月　横浜市立大学医学研究科　優秀論文賞　受賞
  平成22年 4月　横浜市立大学医学会　医学会賞　受賞
  平成22年 4月　文部科学大臣表彰若手科学者賞　受賞
  平成23年11月　第９回分子生物学会三菱化学奨励賞　受賞

• 助教： 高橋 良明　Yoshiaki Takahashi略歴：
  

• 助教： 水口 真理子　Mariko Mizuguchi略歴：
  

研究概要：

　私たちの体では、ナンセンス変異（タンパク質の翻訳が途中で終わってしまう変異）が存在するmRNAを積極的に分解排除する、mRNA監視機構を有し、正常なmRNAとタンパク質の発現を保証しています。一方で、この機構はがん抗原をコードする変異mRNAや、途中まででも機能を有するタンパク質をコードする変異mRNAも分解してしまいます。

　私たちの研究室では、mRNA監視機構の活性が生体内で調節されるメカニズムを、特に細胞ストレスとの関係を中心に理解し、新たな希少遺伝性疾患治療、がん治療法の開発につなげています。また、RNA転写後制御機構であるmRNA監視機構の基礎研究で培った技術基盤を用いることで、様々な疾患の治療・予防法の開発につながる研究を展開することを目指しています。

【大学院生・学振PD募集中】
　本研究室では、臨床応用を見据えた基礎研究を行う、学振PD、大学院生、医師、研究生を募集しています。生物を学んでない分子生物学初心者、情報系学部出身者も歓迎します。医学科、保健学科学生の研究室参加も応援します。
興味のある方はいつでもメールでご連絡ください。
Akyama21＜at＞med.u-ryukyu.ac.jp　※＜at＞は＠に変えてください。